曾经，人类征服自然达到繁荣极致的境界，可是一场名为「火之七日」的大战发生后，荣景从此完全崩塌。在那以后大约一千年，仅存的人类也即将被充满虫和瘴气的腐海吞噬。乘着风、和虫心灵相通、和自然共生存的少女娜乌西卡，在卷入人类诸多纷争的同时，为了拯救地球的未来，凭借一己之力挺身而出。